biomod2

R ensemble species distribution modeling(通过本机 Rscript 调用)
出现点保存在 SQLite 表 species_occurrence ,关联 alien_species;可 GBIF / 手工写入后导出 CSV 供建模。 默认 R 工程目录:/www/wwwroot/easbase/biomod2
Quick start(4 steps)
在下拉框选择物种(数据库记录)
GBIF 导入手工经纬度,并可导出 CSV
点击环境自检确认 Rscript 与 biomod2 可用
在下方编辑 JSON运行入口脚本

GBIF 需外网;单物种单次默认可抓取约 300 条带坐标记录。「批量导入」按学名去重、物种多时较久。 物种基本信息页 也可看图与单行导入。 「批量 biomod2」前先填 raster_dir(可用下方「刷新栅格检测」或 Service 中的 /api/biomod2/raster-hints)。

正在检测 R / biomod2 后端…

在下方组合框中输入学名/中文名/英文名筛选,或点击展开列表选择。

批量 GBIF:按学名代表种扫描。补满:每物种最多 10000 条、不跳过已有记录(GBIF 去重)。非全球每一条记录,仅为 GBIF 带坐标数据。全库较慢。


手工添加一条出现点
环境自检
批量:全库 biomod2

默认与「批量 GBIF」相同:每个清洁学名只取一条代表记录。 勾选每条库记录各跑一遍时,alien_species 中每条 status=active 各占一批(不去重)。 全库可能极耗时;请先试运行或用「最多物种数」限制。 其它 biomod 参数(如 models)会合并自下方 JSON(不含 species / occurrence_csv)。

正在检测本机默认栅格目录…
运行(JSON → R)
建模结果(最近成功)

列出 biomod2_runs 中已成功投影的物种;默认每个学名只显示最新一次。 中国模式会自动生成带国界线的 PNG 预览图(见下方缩略图);GeoTIFF 仍可用于 QGIS 精细制图。 请优先使用 _suitability.tif 单波段文件,勿直接看多波段 stack 的第 1 层 GLM。 验收汇总:下载指标快照 JSON · MaxEnt vs biomod2 对比 · 演示案例

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